管理工程系目前拥有本科、硕士、博士全系列的学位教育，设有信息管理与信息系统国家一流本科专业，拥有管理科学与工程一级学科博士点和硕士点，能源与气候经济、国民经济动员两个二级交叉学科博士点和硕士点，设有管理科学与工程博士后流动站，拥有工程管理硕士等专业硕士学位项目。

管理工程系所在学科为始建于1980年的管理科学与工程学科点，1982年获得兵器系统工程硕士学位授予权，1996年获得博士学位授予权，系全国首批次获管理科学与工程一级学科的单位之一，同年被批准设立博士后流动站。2002年，管理科学与工程学科被评为北京市重点学科，学科点内设置的国民经济动员学科被评为国防特色学科。2012年，管理科学与工程学科被评为工业和信息化部重点学科，信息管理与信息系统本科专业被评为工业和信息化部重点专业。

管理工程系师资队伍目前有34人，其中教授11人，副教授17人，讲师和助理教授6人；博士生导师22人；国家级学术领军人才3人，优秀青年人才7人，中国青年科技奖获得者2人，教育部新世纪优秀人才4人，北京市教学名师1人。